无机物由电导率法来测定。电导率并不能反映出有机物和微生物等的含量。较低电导率的水中可能含有较高的有机物(反之亦然)。有机物，微生物，以及部分微粒，通过检测TOC来反映。 总有机总有机碳分析仪碳的指标在一定意义上说明的是对水污染的监控。如果总有机碳控制在一个较低的水平上，意味着水中有机物、微生物及细菌内毒素的污染处于较好的受控状态。这也是一些验证资料中将总有机碳作为验证项目的重要原因。有机碳进入水系统有几个途径。最常见的是从原水中带进的。TOC的主要来源是生物物质，例如：动植物的腐烂，细菌活动，动物的排泄物。这些生物物质都会通过渗透入水井或溢流进湖泊和河流后进入市政自来水的水这些含TOC的产品的合成物分子量从低到高都有，低分子量的有甲醇，高分子量的有多环物质。有机物的另一个来源是工业废水，杀虫剂，除草剂，化学品。这些化合物的威力相当高，会引起严重的健康问题。在当地环保局和卫生局的指导下，大部分TOC通过净化方法可以从原水中除去。细菌的污染，在某种程度上，存在于所有水系统，细菌的抑制会使TOC变大。不管TOC是何种来源，都需要在制药用水系统中对TOC进行适当的测定，监控和控制。降低水中TOC浓度可通过预处理床，过滤或TOC降解装置来进行。一些有效的过滤方法包括碳床，溶媒过滤和总有机碳分析仪反渗透膜过滤。在使用碳床过滤时，TOC可能和碳分子发生了反应，也可能渗入碳床了。普通的消费者用有一定品质保障的净水设备完全能有效去除、降低水质TOC含量。传统方法：经典的有干烧法、湿烧法等，但是这些测试方法始终停留在实验室、专业机构、工业等领域，由于测试复杂、仪器大型且昂贵，所以普通消费者无法实时测试水质TOC。先把水中有机物的碳氧化成二氧化碳，消除干扰因素后由二氧化碳检测器测定，再由数据处理把二氧化碳气体含量转换成水中有机物的浓度。经过不断的研究实验，TOC检测方法从传统的复杂技术渐渐变成便捷准确。该方法是在氧化之前经磷酸处理待测样品 ,去除无机碳,而后测量 TOC的浓度。现代的TOC连续分析仪中，绝大部分都是湿法氧化。湿法氧化对于复杂的水体(例如:腐殖酸、高分子量化合物等)氧化不充分,所以不适用TOC含量高的水体,但是对于常规水体如地表水、常规海水还是可以的。